孙中山纪念馆是中山陵园管理局直属、具有独立法人资格的正处级事业单位。1989年6月正式对外开放，是景区开展爱国主义教育和对外文化交流的主要阵地和重要窗口。内设办公室、展览部、研究部和社教部四个部门，承担孙中山生平思想和景区民国历史文化资源的挖掘研究、文物征集、展示宣传、社会教育及对外文化交流等工作；同时承担着中山陵全国爱国主义教育基地、海峡两岸交流基地的具体工作。

孙中山纪念馆主楼藏经楼为抗战前由中国佛教会募捐而建，是中山陵园众多纪念性建筑之一。抗战期间，该建筑遭到损毁与破坏。1987年，藏经楼得以修复并辟为孙中山纪念馆，室内外占地面积9500多平米，主体建筑由藏经楼主楼、《三民主义》石刻碑廊、纪念广场三部分组成。纪念馆目前基本陈列为《世纪伟人——孙中山》。在文史研究方面，目前已有30余本数百万字的研究成果出版。在社会教育方面，面向社会、面向青少年，积极开展以弘扬中山精神、构建和谐社会为主要内容的教育活动，成功打造“博爱行动”品牌，取得了良好的社会效益。